Η εξέταση η οποία χρησιμοποιείται σήμερα για τη διάγνωση των νοσημάτων του παχεoς εντέρου είναι η κολονοσκόπηση. Η κολονοσκόπηση είναι μία εξέταση η οποία διαρκεί περίπου 20 – 30 λεπτά. Σε κάθε περίπτωση πραγματοποιείται με τη χορήγηση μέθης, δηλαδή στον ασθενή χορηγείται ένα ήπιο κατασταλτικό φάρμακο έτσι ώστε δεν αντιλαμβάνεται τον πόνο. Η κολονοσκόπηση όταν πραγματοποιείται από έμπειρο, εξειδικευμένο γαστρεντερολόγο είναι μία εντελώς ανώδυνη για τον ασθενή και ασφαλής εξέταση. Στη διάρκεια της κολονοσκόπησης ο γαστρεντερολόγος εξετάζει το παχυ εντερο σε ολόκληρη την έκταση του και έχει τη δυνατότητα να λάβει δείγμα για ιστολογική εξέταση (βιοψία) εφ όσον το κρίνει απαραίτητο. Ένα άλλο μεγαλο πλεονεκτημα της εξετασης είναι ότι ο γαστρεντερολογος μπορεί να εντοπίσει ένα πολύποδα και να τον αφαιρέσει, προλαμβάνοντας έτσι την πιθανή μελλοντική εξέλιξή του σε καρκίνο. Με αυτή την έννοια η κολονοσκόπηση αποτελεί εξέταση ιδανική για την πρόληψη του καρκίνου του παχεος εντέρου